1865. március. Az Egyesült Államokban a polgárháború alatt öt daredevil-északiak egy léggömb elmenekültek Richmond déli részéről. Szörnyű vihar kettesből dob egy lakatlan sziget partjára a déli féltekén. Az ötödik ember és kutyája a tenger partján rejtőzik. Ez az ötödik - egy bizonyos Cyres Smith, egy tehetséges mérnök és tudós, az utazók egy csoportjának lelke és vezetője - akaratlanul néhány napig feszültség alatt tartja társait, akik sehol sem találják meg őt vagy a neki odaadó Top kutyát. A korábbi rabszolga szenved elsősorban, és Smith hűséges szolgája a néger náb. A léggömbben egy háború újságíró és Smith barátja, Gideon Spilet is volt, nagyon energikus és határozott, keserű gondolkodású; tengerész, Pencrof, jóindulatú és kalandos merész ördög; A tizenöt éves Harbert Brown, a hajó kapitányának fia, amelyen Pencroff vitorlázott, árva maradt, és akit a tengerész saját fiának tekint. Fárasztó keresés után Nab végül megtalálja megmagyarázhatatlanul megmentett gazdaját, egy mérföldnyire a parttól. A sziget új településeinek pótolhatatlan tehetsége van, és Cyres és Spilet vezetésével ezek a bátor emberek összegyűlnek és egyesített csapattá válnak. Először, a legegyszerűbb eszközökkel, majd egyre összetettebb munka- és háztartási cikkek előállításával saját kis gyáraikban a telepesek felszerelik életüket. Vadásznak, ehető növényeket, osztrigakat gyűjtenek, majd háziállatokat tenyésztenek és gazdálkodással foglalkoznak. Megszervezik maguknak a magukat a sziklában, a víztől mentes barlangban. Kemény munkájuk és intelligenciájuknak köszönhetően a gyarmatosítók hamarosan nem tudják, hogy szükség van-e ételre, ruhára, melegre és kényelemre. Mindent megkapnak, kivéve a hazájukról szóló híreket, amelyek sorsa miatt nagyon aggódnak.
Miután visszatértek lakásukba, amelyet Granitok Palotának hívtak, azt látják, hogy a majmok főnökök. Egy idő után, mintha őrült félelem hatására a majmok elkezdenek kiugrni az ablakon, és valaki a kezével dobja a kötél létrát, amelyet a majmok a házba emetettek. Belül az emberek találnak egy másik majomot - egy orangutánot, amelyet őriznek és Jupe bácsinak hívnak. A jövőben Jupe barátja, szolgája és nélkülözhetetlen segítője lesz az embereknek.
Egy másik napon a telepesek a homokba dobozt találnak szerszámokkal, lőfegyverekkel, különféle eszközökkel, ruhákkal, konyhai eszközökkel és angol nyelvű könyvekkel. A telepesek azon gondolkodnak, honnan származhatott ez a doboz. A térképen, amely szintén megjelenik a dobozban, úgy találják, hogy szigetük mellett, a meg nem jelölt térképen Tabor szigete. A Pencrof tengerész lelkesen megy hozzá. Barátainak segítségével botot épít. Amikor a bot készen áll, együtt mennek egy próbajáratra a sziget körül. Ennek során találnak egy palackot, melyben egy feljegyzés található, hogy a hajótörött ember megváltásra vár Tabor szigeten. Ez az esemény erősíti Pencroff bizalmát egy szomszédos sziget meglátogatásában. Pencrof, Gideon Spilet újságíró és Harbert vitorláztak. A Taborba érkezve felfedeznek egy kis kunyhót, ahol minden jel szerint senki sem él hosszú ideje. Szétoszlanak a szigeten, nem számítanak arra, hogy élő embert találnak, és megpróbálják megtalálni legalább a maradványait. Hirtelen meghallják Harbert sikoltozását és sietett a segítségére. Látják, hogy Harbert valamilyen majomtenyésztett lény küzd. A majom azonban kiderül, hogy vad ember. Az utazók megkötik és szállítják a szigetre. Külön szobát adnak neki a Gránit Palotában. Figyelem és figyelmüknek köszönhetően a vadon hamarosan visszakerül civilizált emberré és elmondja nekik a történetét. Kiderül, hogy Ayrton neve, volt bűnöző, a Duncan vitorlás hajót akarta birtokba venni, és a társadalom ugyanazon dudájának segítségével kalózhajóvá vált. Terveinek azonban nem volt szándéka, hogy valóra váljon, és büntetésként tizenkét évvel ezelőtt a lakatlan Tabori szigeten hagyták, hogy megértse cselekedetét és engesztelje bűneit. Eduard Glenarvan azonban a "Duncan" tulajdonosát mondta, hogy egyszer visszatér Ayrtonba. A telepesek látják, hogy Ayrton őszintén megbánja korábbi bűneit, és mindenképpen megpróbál számukra hasznos lenni. Ezért nem hajlandóak megítélni őt korábbi kötelességszegés miatt, és szívesen fogadják el őt a társadalomban. Ayrtonnak azonban időre van szüksége, és ezért lehetőséget kér arra, hogy éljen a korallban, amelyet a telepesek háziállataik számára építettek a Granit-palotától bizonyos távolságra.
Amikor a bot éjjel visszatért a viharhoz a Tabor-szigetről, azt egy máglya mentette ki, amelyet, ahogyan gondoltak, rajta úsztak, a barátaik meggyújtották. Kiderül azonban, hogy nem vettek részt ebben. Kiderül, hogy Ayrton nem dobott egy üveg jegyzetet a tengerbe. A telepesek nem tudják megmagyarázni ezeket a titokzatos eseményeket. Egyre inkább hajlamosak arra a gondolatra, hogy amellett, hogy Lincoln-szigeten kereszteltek, van valaki más, aki él, titokzatos segítője, aki gyakran a legnehezebb helyzetekben kap segítséget. Még kutatási expedíciót indítanak abban a reményben, hogy lakóhelyét megkeresik. A keresés azonban eredménytelen.
A következő nyáron (mivel azóta, amikor Ayrton megjelent a szigeten, és mielőtt elmondta nekik a történetet, már öt hónap telt el, és a nyár véget ért, és a hideg évszakban veszélyes vitorlázni), úgy döntenek, hogy visszatérnek Tabor-szigetek hagyja a feljegyzését a kunyhóban. A feljegyzésben figyelmeztetni szándékoznak Glenarvan kapitányt, ha visszatér, hogy Ayrton és öt másik roncsos áldozat segítségre vár egy szomszédos szigeten.
A telepesek három éve élnek a szigeten. Életük, gazdaságuk elérte a jólétet. Már betakarítják az egyszemű gabonafélékből gazdag gabonanövényeket, amelyeket három évvel ezelőtt találtak a Harbert zsebében, malomot építettek, baromfit emelték, teljesen felszerelték lakásukat, új meleg ruhákat és takarókat készítettek maguknak muflongyapjúból. Békés életüket azonban egy olyan esemény beborítja, amely halállal fenyegeti őket. Egyszer a tengerre nézve egy jól felszerelt hajót látnak a távolban, de egy fekete zászló repül a hajó fölött. A hajó horgonyzik a parton. Gyönyörű hosszú hatótávolságú fegyvereket mutat. Ayrton éjszakai fedél alatt becsúszik a hajóba, hogy felderítsen. Kiderül, hogy ötven kalóz van a hajón. Csodálatosan elcsúszik tőlük, Ayrton visszatér a partra, és értesíti a barátait, hogy fel kell készülniük a csatára. Másnap reggel két hajó száll le a hajóról. Az egyikben a telepesek háromst lőnek, és ő visszatér, a második a partra száll, és a hat maradék kalóz az ő erdőben rejtőzik. Az ágyúkat megsérült a hajó, és még közelebb jön a parthoz. Úgy tűnik, hogy semmi nem képes megmenteni maroknyi telepeseket. Hirtelen egy hatalmas hullám hullámzik fel a hajó alatt, és elsüllyed. Az összes rajta lévő kalóz meghal. Mint később kiderül, a hajót egy akna robbantotta fel, és ez az esemény végül meggyőzi a sziget lakosait, hogy nincsenek itt egyedül.
Először nem fogják megsemmisíteni a kalózokat, mert lehetőséget akarnak adni nekik, hogy békés életet éljenek. De kiderül, hogy a rablók erre nem képesek. Elkezdik rabolni és elégetik a telepesek háztartásait. Ayrton megy a korallhoz, hogy meglátogassa az állatokat. A kalózok megragadják, és egy barlangba viszik, ahol meg akarják kínozni, hogy egyetértenek azzal, hogy kínzásukkal az oldalukra mennek. Ayrton nem adja fel. Barátai segítséget kapnak, de súlyosan megsérülnek Harbert koralljában, és barátai benne maradnak, és nem tudnak visszamenni a haldokló fiatalemberhez. Néhány nap múlva továbbra is elmennek a Gránitpalotába. Az átmenet eredményeként Harbert rosszindulatú lázat kezd, halálán van. A gondviselés ismét beavatkozik életükbe, és jó titokzatos barátjuk keze dobja a szükséges gyógyszert. Harbert teljesen felépül. A telepesek szándékában áll a kalózoknak adni a végső csapást. A korallhoz mennek, ahol meg akarják találni őket, de megtalálják Ayrtont, aki kimerült és alig él, és a közelben található a rablók holttesteivel. Ayrton jelentése szerint nem tudja, hogy került a korallba, aki kihozta a barlangból és megölte a kalózokat. Bejelent egy szomorú hírt. Egy hete a banditák a tengerbe mentek, de nem tudva, hogyan kell irányítani a botot, betörték a parti zátonyokon. A Taborba vezető utat új jármű gyártásáig el kell halasztani. A következő hét hónapban a titokzatos idegen nem érezte magát. Időközben egy vulkán ébred fel a szigeten, amely szerint a gyarmatosítók már halottak. Új nagy hajót építenek, amelyet szükség esetén lakott földre szállíthatnak.
Egy este, már készülve lefeküdni, a Gránit Palota lakói csengőhangot hallnak. A távíró, amelyet a koralltól otthonukig töltöttek, működik. Sürgősen hívják őket a korallba. Ott találnak egy jegyzetet, amelyben felkérik őket, hogy menjenek el a kiegészítő huzal mentén. A kábel egy hatalmas barlangba vezet, ahol csodálkozva tengeralattjárót látnak. Ebben találkoznak mesterükkel és mecénásukkal, Nemo kapitánnyal, Dakkar indiai herceggel, aki egész életében harcolt szülőföldének függetlenségéért. Ő, már hatvan éves ember, aki eltemette társait, halál közelében van. Nemo ad új barátoknak koporsót ékszerekkel és figyelmezteti, hogy amikor a vulkán kitör, a sziget (ilyen a szerkezete) felrobban. Meghal, a telepesek megfordítják a hajó nyílásait és leeresztik a víz alá, és egész nap fáradhatatlanul építik az új hajót. Nincs azonban idejük befejezni. Az egész élet elpusztul a sziget robbanása során, ahonnan csak egy kis zátony marad az óceánban. A telepeseket, akik éjszakát egy sátorban töltöttek a tengerparton, léghullámok vetik a tengerbe. Jupe kivételével mindegyik életben marad. Több mint tíz napig ülnek a zátonyon, majdnem meghaltak az éhezésből és már semmit sem reméltek. Hirtelen egy hajót látnak. Ez Duncan. Mindenkit megmenti. Mint később kiderül, Nemo kapitány, miközben a bot még ép volt, lebegett rajta Tabor felé, és jegyzetet hagyott a mentők számára.
Visszatérve Amerikába a Nemo kapitány által ajándékozott ékszerekért, a barátok nagy darab földet vesznek, és ugyanúgy élnek rajta, mint a Lincoln-szigeten.