Borisov esküvőjének napján, a trónra, a császárok kiszámítják uralkodásának gyümölcseit: az elfojtott járványt, a befejezett háborúkat és a termést. Csodálkoznak amiatt, hogy Godunovnak mennyi ideig kellett rávennie rá, hogy hatalmát vigye, és ezt csak az exkommunikáció fenyegette. Boris visszatér a katedrálisból, nagyköveteket kíván fogadni. Voeikov bejelenti győzelmét a szibériai kán felett. Az angol nagykövet felajánlja a menyasszonyot Tsarevich Fedornak; pápai nuncio - megállapodás az egyházak egyesítéséről; Az osztrák, litván, svéd és firenzei nagykövetek tisztelettel kérnek valakit segítségért pénzzel vagy csapatokkal, akik vagyonuk elismerése érdekében. A perzsa és a török nagykövet vádolják egymást Ibéria támadásában. Az ibériai király nagykövete védelmet kér. A cár mindenki számára megfelelő választ ad, méltóságteljes és erőteljes, és mindenkit enged be a királyi kamarába („Nincs akadály az orosz nép és a cár között!”). Egyedül hagyva, Boris diadalmaskodik, és a herceg halálára emlékezve úgy dönt: akkor az állam nagyságának elkerülhetetlen ára. Nem sokkal ezután, miközben a kolostor cellájában várja, hogy Irina megvágja a haját, Boris meghallgatja Semyon Godunov jelentéseit a Romanovoknak, akik elégedetlenek a Szent György napjának visszavonásával; Vaszilij Shuisky ellen, egy ravasz és megbízhatatlan szolga ellen, ám hatalmában bízik, nem akarja senkit megbüntetni. Irina megjelenik, és Boris, emlékeztetve a hatalom felé vezető vándorlásait, azt kéri, hogy igazolja őt, és elismeri, hogy Oroszország prosperitása megéri az igazságot, amelyen keresztül király lett. Irina, jóváhagyva királyságát, azt követeli, hogy ne felejtsd el bűntudatát, és ne bocsásson meg magának. Ha magukkal maradnak, elválnak.
A palotában Borisz, Fyodor és Xenia gyermekei meghallgatják a keresztény, a dán herceg, Xenia menyasszonya történeteit - a szörnyű gyermekkorról, a bírósághoz való visszatérésről, a Flandria csatáiról a spanyol csapatokkal, de amikor Fedor panaszkodik tétlenségéről, Christian észreveszi, hogy pozíciója, amely lehetővé teszi számára, hogy bölcs szuverén alatt tanulmányozza az uralmat, sokkal méltóbb. Christian elmondja, hogy szerette Kseniát nagykövetek, kereskedők és foglyok története szerint, akik Oroszország nagyságával együtt dicsérték a hercegnő szépségét, intelligenciáját és szelídségét. Beszélni kezdenek Borisról, és mindenki egyetért a szeretettel a cár iránt, aki elfelejti magát az állam dicsőségéért és jólétéért. Mindhárom esküszöm, hogy segítenek egymásnak. Christian arra kéri Borist, aki háború esetén belépett, hogy engedje meg az orosz csapatok vezetését, de a cárt elriasztja az évek óta tartó béke. A gyerekek távoznak, és Semyon Godunov, aki eljött, bejelenti pletykát a csodálatosan megmentett Dimitri hercegről. Kamráiban Tsarina Maria Grigorijevna megkérdezi Vlasyev hivatalnokot a kereszténységről, és függetlenül attól, hogy Júlia Vlaszjev mennyiben van, rájön, hogy van egy érzés, hogy a király nem az apja, és az öreg testvére, aki most uralkodik, nem kedveli őt. Ha nem ismeri el a tisztviselő ígéretét, hogy igazolja Borist, hívja Dementjevnát, és egyre inkább ingerülten megtudja, hogy Ksenia testvérével és vőlegényével ült, és a cár üdvözli az új szokásokat. A Volokhovhoz érkező csarina azt kifogásolja, hogy Borisz megragadta Kseniát a németekért anélkül, hogy megkérdezte volna tőle, és a németek nyilvánvalóan bekapcsolták a hercegnőt. Volokhov vállalja, hogy megismeri, mi a keresztény erőssége, és összetörni tudja azt („Van ilyen gyökér”). Az erdőben, a rabló táborban Ataman Khlopko elfogadja a parasztok újbóli feltöltését, Borisz átkozását és a Szent György napjának eltörlését. Megjelenik egy Posadsky, aki félelem nélkül meg akarja engedni társait, akiket egy rablójelző elfogott a moszkvai úton, és beszámol a valós hírekről Tsarevich Dimitri megjelenéséről. Posadsky megverte Khlopot, hogy Brianszkba menjen, ahol a Tsarevich csapatainak meggyalázása után megbocsátást kapnak és harcolnak Godunov ellen. Mitka megjelenik, és két elmenekülõ szerzetes, Mihail Povadin és Grishka Otrepyev húzásával vonzza a gyapotsereget. Amikor Posadsky, miután szórakoztatta a rablókat, miközben harcolt Mitkával, és megparancsolta, hogy hordót dobjon ki borhoz, hirtelen eltűnik, kiderül, hogy a vele járó szerzetesek nem tudják, ki ő.
Boris kénytelen beismerni, hogy egy új ellenség megjelenése egy véres úton tolta őt. Semyon Godunov, akinek a vádját megtudta, ki bujkál Demetrius név mögött, azt mondja, hogy a kínzás árán nem tudott semmit. Kutatják Grishka Otrepyev nevét, egy szökött csoda szerzetes nevét, hogy valamilyen módon átnevezzék az ellenséget. Boris utasítja a kémek szaporítását és bizonyítékok megtalálását a Romanovokról, és emellett a folyamatos éhség miatt adják át a pénztárcát az embereknek, utasítva, hogy ne hallgassa meg a hercegről szóló meséket. Tsarevich Fedor azt kéri, hogy küldje el a csapatokhoz; Tsarevna Ksenia gyászolja Borisz változását és kegyetlenségét; Egy keresztény megkérdezi, hogy Boris biztos-e a Tsarevich halálában, és elmondja a pletykákat. A gyerekek távoznak, a királynő megjelenik, tele van maró érzékenységgel és irritációval a kereszténynél, a gyerekekkel a "királyról" beszélve. A király süket marad annak kérésére, hogy küldje el a keresztényt. Semjon Godunov beszámol az árulók gyors előrehaladásáról, a csapatok számukra történő átruházásáról és Basmanov makacs ellenállásáról. Vaszilij Shuisky felkéri Borist, hogy maga menjen el a csapatokba, vagy küldje el a királynő királynőt, hogy tanúsítsa fiának halálát. Megrendelte Shuiskyt, hogy szakítsa el a nyelveket azoknak, akik a pletykákat terjesztik. Boris elküldi Dimitryt anyjának. Nikitich Romanov Fedor házában Romanovák, Sitsky, Repnin és Cserkasszky császárok italt a hercegért. Shuisky megérkezik, beszámol Boris parancsairól, és Uglichben keresették fel, homályosan válaszol. Semjon Godunov íjászokkal, azzal vádolva a közönséget, hogy mérgezéssel meg akarják mérgezni az országot, mindenkit őrizetbe vesznek, és Vaszilij Shuiskyt vezetik ki kihallgatás céljából. Boris, aki egyedül gondolkodott egy teljesült előrejelzésről („Meggyilkolt, de él”), aki Shuiskybe jött, elrendelte, hogy nyújtsa be az elülső oldalról, hogy ő maga látta a cár holttestét Uglichban. Eközben a tanácsadók Christian felé fordulnak, és elmagyarázzák, hogy meg kell tagadnia Ksenia feleségül vételét, hogy Boris félelmével elárulta magát, hogy Ksenia gazember lánya és szolga. Christian, érezve a közeledő fejfájást, hisz Boris bűntudatában, nem tudja, mit kell döntenie. Ksenia jön, és szavakban és gondolatokban zavartan beszél az elkerülhetetlen szétválásról, majd felszólítja, hogy meneküljen tőle a gyilkos apjától. Fjodor, aki csendben belépett, az apja mellett áll, harcolni fognak. Ksenia sírva emlékezteti az egymásnak adott esküt. Christian dühöng, és betegnek tekintve Ksenia és Fedor elvezetik.
A Vörös téren a nyomozók hallgatják a Tsarevich Dimitri követelményéből sétáló emberek közötti beszélgetéseket (ott hirdették ki Grishka anatémáját). A nyomozókat provokálva, a nekik megfelelő módon értelmezve a nyomozók szinte mindenkit megragadnak egymás után. Vaszilij Shuisky, a kivégzés helyéről, félreérthető beszédet mond az előrehaladó ellenségről, és az Uglichban folytatott kutatásról beszél, így továbbra sem világos, ki volt a gyilkolt csecsemő. Körülbelül ebben az időben a herceg édesanyja, amelyet a kolostorból hoztak, most Martha apáca, aki Boriszra vár és bosszút vágyik, úgy dönt, hogy elismeri a csalók fiát; azt mondja, hogy nem látta elhunyt fiát, mert elvesztette érzéseit, és az emlékmű szolgálatában könnyek borították a szemét. Most, miután meghallotta a megjelent Tsarevics jeleit, beismeri, hogy csodával csodálatos módon megmentette és életben volt. Mária Grigorijevna csaritsa, aki el akarja ítélni a csalást, bemutatja Volokhovot. A bánat, amely Martát megragadta fia gyilkosának látásakor, elárulja őt, de megtagadja Demetrius halálának nyilvános beismerését. Hamarosan az orvos jelentést készít Borisznak Christian egészségének romlásáról és tehetetlenségéről. Semyon Godunov Dimitry Ioannovich levelét hozza, amelyben Borist leginkább lenyomja a trón önkéntes lemondása esetén megígért kegyelem, és ezért a tolvaj bizalma az egyetemes támogatásban. Boris azt akarja, hogy hozzon egy rövidszőrű Kleshnint, hogy megbizonyosodjon a herceg haláláról. Keresztény neve, és hamarosan értesíti Xenia-t és Fedort haláláról.
Két őr, akik éjjeli őröt viselnek a trón kamrájában, félelemben rejtőznek, amikor az álmatlan Boris megjelenik. Valaki elképzel valaki képét a trónon, és megtalálja az őröket, és elküldi őket, hogy ellenőrizze, ki ül ott. Semjon Godunov elhozza Kleshnint, aki megerősíti Demetrius halálát, és emlékeztet arra, hogy a Boriszov uralkodásának ideje, amelyet a mágusok előre jeleztek, véget ér, felszólítja bűnbánatra és távozzon a kolostorba. Reggel, amikor Basmanovtól érkezett információk, amelyek megérkeztek a "tolvaj" részleges győzelméről, Boris elmondja Fedornak a trónhoz való feleségülvétel szükségességéről és az esküről, amellyel a fiúk eljönnek. Fedor elhagyja a trónt, mert nem biztos abban, hogy a "tolvaj" nem Demetrius. Boris értelmesen felajánlja, hogy bemutatja Fedornak a Tsarevich halálának tagadhatatlan bizonyítékait, és miután megértette apjának bűncselekményét, rettegésben visszautasítja a bizonyítékokat, és kijelenti, hogy elfogadja a koronát. Az ebédlőben, Basmanovot és a cárt várva, a császárok mind átkoznak, mind híreket cserélnek a "hercegről". Basmanov belép, panaszkodva a nem megfelelő kiutasításáról. Boris megjelenik a gyerekekkel. Boris jutalmazza Basmanovot. A fiúk, megfigyelve Xenia szomorúságát, megbánják, és azon gondolkodnak, hogy mit kezdjenek vele, "amikor a királyságba jön". Boris megköveteli Fedor iránti hűséges esküt és ezen eskü jóváhagyását a katedrálisban, elveszíti erejét és esik. Általános zavarban kijelenti, hogy halálának oka nem a méreg, hanem a bánat, a fiúknak esküt tartva hagyja, és emlékeztet arra, hogy „csak a gonosz születik a gonoszból”, és Fedor királynak nyilvánítva távozik